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Volume 13; Issue 4 Suppleme
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BMC Bioinformatics
Volume 13; Issue 4 Suppleme
BMC Bioinformatics
Volume 13; Issue 4 Suppleme
1
Accurate multiple sequence alignment of transmembrane proteins with PSI-Coffee
Jia-Ming Chang
,
Paolo Di Tommaso
,
Jean-François Taly
,
Cedric Notredame
Journal:
BMC Bioinformatics
Année:
2012
Langue:
english
Fichier:
PDF, 388 KB
Vos balises:
english, 2012
2
Stochastic simulations of minimal cells: the Ribocell model
Fabio Mavelli
Journal:
BMC Bioinformatics
Année:
2012
Langue:
english
Fichier:
PDF, 1.18 MB
Vos balises:
english, 2012
3
Characterization of an inducible promoter in different DNA copy number conditions
Susanna Zucca
,
Lorenzo Pasotti
,
Giuliano Mazzini
,
Maria Gabriella Cusella De Angelis
,
Paolo Magni
Journal:
BMC Bioinformatics
Année:
2012
Langue:
english
Fichier:
PDF, 437 KB
Vos balises:
english, 2012
4
In-silicoandin-vivoanalyses of EST databases unveil conserved miRNAs fromCarthamus tinctoriusandCynara cardunculus
Domenico Catalano
,
Domenico Pignone
,
Gabriella Sonnante
,
Mariella M Finetti-Sialer
Journal:
BMC Bioinformatics
Année:
2012
Langue:
english
Fichier:
PDF, 534 KB
Vos balises:
english, 2012
5
Design of a multi-signature ensemble classifier predicting neuroblastoma patients' outcome
Andrea Cornero
,
Massimo Acquaviva
,
Paolo Fardin
,
Rogier Versteeg
,
Alexander Schramm
,
Alessandra Eva
,
Maria Carla Bosco
,
Fabiola Blengio
,
Sara Barzaghi
,
Luigi Varesio
Journal:
BMC Bioinformatics
Année:
2012
Langue:
english
Fichier:
PDF, 413 KB
Vos balises:
english, 2012
6
Argot2: a large scale function prediction tool relying on semantic similarity of weighted Gene Ontology terms
Marco Falda
,
Stefano Toppo
,
Alessandro Pescarolo
,
Enrico Lavezzo
,
Barbara Di Camillo
,
Andrea Facchinetti
,
Elisa Cilia
,
Riccardo Velasco
,
Paolo Fontana
Journal:
BMC Bioinformatics
Année:
2012
Langue:
english
Fichier:
PDF, 473 KB
Vos balises:
english, 2012
7
Primates and mouse NumtS in the UCSC Genome Browser
Francesco Maria Calabrese
,
Domenico Simone
,
Marcella Attimonelli
Journal:
BMC Bioinformatics
Année:
2012
Langue:
english
Fichier:
PDF, 1.18 MB
Vos balises:
english, 2012
8
Intuitive representation of surface properties of biomolecules using BioBlender
Raluca Mihaela Andrei
,
Marco Callieri
,
Maria Francesca Zini
,
Tiziana Loni
,
Giuseppe Maraziti
,
Mike Chen Pan
,
Monica Zoppè
Journal:
BMC Bioinformatics
Année:
2012
Langue:
english
Fichier:
PDF, 759 KB
Vos balises:
english, 2012
9
Identification of binding pockets in protein structures using a knowledge-based potential derived from local structural similarities
Valerio Bianchi
,
Pier Federico Gherardini
,
Manuela Helmer-Citterich
,
Gabriele Ausiello
Journal:
BMC Bioinformatics
Année:
2012
Langue:
english
Fichier:
PDF, 598 KB
Vos balises:
english, 2012
10
Bluues: a program for the analysis of the electrostatic properties of proteins based on generalized Born radii
Federico Fogolari
,
Alessandra Corazza
,
Vijaylakshmi Yarra
,
Anusha Jalaru
,
Paolo Viglino
,
Gennaro Esposito
Journal:
BMC Bioinformatics
Année:
2012
Langue:
english
Fichier:
PDF, 691 KB
Vos balises:
english, 2012
11
CONS-COCOMAPS: a novel tool to measure and visualize the conservation of inter-residue contacts in multiple docking solutions
Anna Vangone
,
Romina Oliva
,
Luigi Cavallo
Journal:
BMC Bioinformatics
Année:
2012
Langue:
english
Fichier:
PDF, 380 KB
Vos balises:
english, 2012
12
PyMod: sequence similarity searches, multiple sequence-structure alignments, and homology modeling within PyMOL
Emanuele Bramucci
,
Alessandro Paiardini
,
Francesco Bossa
,
Stefano Pascarella
Journal:
BMC Bioinformatics
Année:
2012
Langue:
english
Fichier:
PDF, 642 KB
Vos balises:
english, 2012
13
Modeling gene regulatory network motifs using statecharts
Fabio Fioravanti
,
Manuela Helmer-Citterich
,
Enrico Nardelli
Journal:
BMC Bioinformatics
Année:
2012
Langue:
english
Fichier:
PDF, 934 KB
Vos balises:
english, 2012
14
BEAT: Bioinformatics Exon Array Tool to store, analyze and visualize Affymetrix GeneChip Human Exon Array data from disease experiments
Arianna Consiglio
,
Massimo Carella
,
Giorgio De Caro
,
Gianfranco Delle Foglie
,
Candida Giovannelli
,
Giorgio Grillo
,
Massimo Ianigro
,
Flavio Licciulli
,
Orazio Palumbo
,
Ada Piepoli
,
Elena Ranieri
,
Sabino
Journal:
BMC Bioinformatics
Année:
2012
Langue:
english
Fichier:
PDF, 1.15 MB
Vos balises:
english, 2012
15
Improving biomarker list stability by integration of biological knowledge in the learning process
Tiziana Sanavia
,
Fabio Aiolli
,
Giovanni Da San Martino
,
Andrea Bisognin
,
Barbara Di Camillo
Journal:
BMC Bioinformatics
Année:
2012
Langue:
english
Fichier:
PDF, 302 KB
Vos balises:
english, 2012
16
Tandem repeats discovery service (TReaDS) applied to finding novel cis-acting factors in repeat expansion diseases
Marco Pellegrini
,
Maria Elena Renda
,
Alessio Vecchio
Journal:
BMC Bioinformatics
Année:
2012
Langue:
english
Fichier:
PDF, 1.10 MB
Vos balises:
english, 2012
17
GIDL: a rule based expert system for GenBank Intelligent Data Loading into the Molecular Biodiversity database
Paolo Pannarale
,
Domenico Catalano
,
Giorgio De Caro
,
Giorgio Grillo
,
Pietro Leo
,
Graziano Pappadà
,
Francesco Rubino
,
Gaetano Scioscia
,
Flavio Licciulli
Journal:
BMC Bioinformatics
Année:
2012
Langue:
english
Fichier:
PDF, 764 KB
Vos balises:
english, 2012
18
An ICT infrastructure to integrate clinical and molecular data in oncology research
Daniele Segagni
,
Valentina Tibollo
,
Arianna Dagliati
,
Alberto Zambelli
,
Silvia G Priori
,
Riccardo Bellazzi
Journal:
BMC Bioinformatics
Année:
2012
Langue:
english
Fichier:
PDF, 466 KB
Vos balises:
english, 2012
19
OREMPdb: a semantic dictionary of computational pathway models
Renato Umeton
,
Giuseppe Nicosia
,
C Forbes Dewey
Journal:
BMC Bioinformatics
Année:
2012
Langue:
english
Fichier:
PDF, 524 KB
Vos balises:
english, 2012
20
Towards linked open gene mutations data
Achille Zappa
,
Andrea Splendiani
,
Paolo Romano
Journal:
BMC Bioinformatics
Année:
2012
Langue:
english
Fichier:
PDF, 482 KB
Vos balises:
english, 2012
21
Fine-tuning anti-tumor immunotherapies via stochastic simulations
Giulio Caravagna
,
Roberto Barbuti
,
Alberto d’Onofrio
Journal:
BMC Bioinformatics
Année:
2012
Langue:
english
Fichier:
PDF, 488 KB
Vos balises:
english, 2012
22
Characterization of the emergent properties of a synthetic quasi-cellular system
Lorenzo Lazzerini-Ospri
,
Pasquale Stano
,
PierLuigi Luisi
,
Roberto Marangoni
Journal:
BMC Bioinformatics
Année:
2012
Langue:
english
Fichier:
PDF, 377 KB
Vos balises:
english, 2012
23
Bioinformatics in Italy: BITS2011, the Eighth Annual Meeting of the Italian Society of Bioinformatics
Paolo Romano, Manuela Helmer-Citterich
Journal:
BMC Bioinformatics
Année:
2012
Langue:
english
Fichier:
PDF, 112 KB
Vos balises:
english, 2012
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